La qualità principale della soia è l'elevato valore proteico, caratteristica questa che la differenzia da tutti gli altri vegetali. Inoltre le sue proteine hanno un buon valore biologico in quanto, pur non comprendendo tutti gli amminoacidi essenziali all'organismo, si avvicinano moltissimo alla qualità delle proteine animali, e le minime carenze che registra sono facilmente compensabili con adeguate combinazioni alimentari (mangiandola, ad esempio, con altri vegetali).